В далеком 1930 году в образовательной степи Казахстан был открыт первый медицинский институт, директором института был назначен выпускник Императорской Военно-Медицинской Академии Санжар Джафарович Асфендияров, имя которого сейчас с честью носит университет.
История создания и развития факультета берет начало со дня подписания приказа № 245 от 28.06.1959 года (об открытии стоматологического факультета) министром здравоохранения Казахской ССР проф. Карынбаевым Сибугатулла Рыскалиевич.
С этого дня, со дня открытия стоматологического факультета берет точка отсчета высшее стоматологическое образования республики.