Кафедраның ғылыми зерттеулерінің негізгі тақырыбы “жақ-бет аймағының қабыну және травматикалық зақымдануы бар науқастарды дамыту және оңалту”, “репаративті хирургия”, “операциядан кейінгі жаралар мен жақтың сүйек қуыстарын емдеуді оңтайландыру”болып табылады. 2011 жылдан бастап қызметкерлер 10 ғылыми-техникалық бағдарламаның жұмысына қатысты, нәтижесінде 60 мақала жарияланды, оның ішінде ЖАК – 20 басылымдарында, нөлдік емес импакт-факторы бар шетелдік басылымдарда – 5, баяндамалары бар конгресстер мен ғылыми-практикалық конференцияларға қатысу – 50, енгізулер – 17, патенттер – 5. Кафедрада соңғы жылдары бес магистрлік диссертация қорғалды (Жақсылықова М., Ильясова Э., Балқан А., Бөріхан Е., Кобеков С.) және бір PhD докторы(Менчишева Ю. А.) PhD докторантурасын 2023 жылы Д. Д. Менжанова, А. С. Әжібеков бітірді. Қазіргі уақытта бір PhD докторант М. М. Мугалбаева оқиды.

Хирургиялық стоматология кафедрасының ғылыми-техникалық жобалары:

1. 2021-2023 іске асыру мерзімімен “ауызша хирургияда инновациялық жедел технологиялар мен плазмалық ұнтақты қолдану” тақырыбында ғылыми және ғылыми-техникалық жобалар бойынша жас ғалымдарды гранттық қаржыландыруға арналған жоба. Шарттың шифры, нөмірі, қол қойылған күні және мемлекеттік тіркеу нөмірі: № AP09057870 №65-км
2. 2 24.02.2021 ж., 0121РК00023 2. ҚР ДСМ, 2011-2013жж.Қазақстанның егде жастағы тұлғаларының белсенді ұзақ өмір сүруін қамтамасыз етуде қартаюға қарсы бағдарламаны әзірлеу.
3. “Дентальды имплантация кезінде жасушалық технологияларды қолдану” (ҚР БҒМ, 2011; ҚазҰМУ, 2013)
4. “Трансляциялық медицинаны қалыптастыру мен дамытудың ғылыми-әдістемелік негіздемесі”. Басшылар: г. О. Устенова, г. С. Стабаева 2012-2014жж.
5. Жүректің ишемиялық ауруының даму қаупі факторы ретінде жалпыланған периодонтиттің әсерін бағалау (ҚазҰМУ, 2013)
6. “Күйік және хирургиялық жараларды емдеуге арналған табиғи полимерлерге негізделген биопротекциялар”. Жетекшісі Кауланбаева М. З., меңгерушісі.лаб. “Антиген” ҰКП ЖШС жасушалық технологиясы. Отв. Исп. Стабаева г. с. 2014-2016жж. ҚР БҒМ
7. “Терінің тіндік эквивалентін қолданудың тәжірибелік негіздемесін әзірлеу” жетекшісі Г. С. Стабаева 2015 жыл, ҚазҰМУ
8. “Қазақстан Республикасында пародонттың қабыну ауруларын диагностикалау, емдеу және болжаудың кешенді бағдарламасын әзірлеу” жоба жетекшісі Ермұхановаг.Т., фрагмент жетекшісі В. П. Русанов 2015-2017 ҚР БҒМ
9. “Терінің әзірленген отандық тіндік эквивалентінің тиімділігі мен қауіпсіздігін шектеулі клиникалық зерттеу” жетекшісі Г. С. Стабаева 2016 жылқазұму
10. EXE, HTML форматында электрондық оқу-әдістемелік кешендерді құру жөніндегі нұсқаулықты әзірлеу және енгізу негізінде білім беру процесін оңтайландыру. Жетекшісі Вансванов М. И. 2016, ҚазҰМУ