Кафедраның ғылыми зерттеулерінің негізгі бағыттары: «Жақ-бет аймағының қабыну және жарақаттық зақымданулары бар науқастарды емдеу және оңалту әдістерін әзірлеу», «Репаративтік хирургия», «Операциядан кейінгі жаралар мен жақ сүйектерінің сүйек қуыстарының жазылуын оңтайландыру».
2011 жылдан бастап кафедра қызметкерлері 10 ғылыми-техникалық бағдарламаны іске асыруға қатысты. Ғылыми-зерттеу жұмыстарының нәтижесінде 60 ғылыми мақала жарияланды, оның ішінде 20 мақала – уәкілетті орган ұсынған ғылыми басылымдарда, 5 мақала – импакт-факторы нөлден жоғары шетелдік ғылыми басылымдарда жарық көрді. Кафедра қызметкерлері конгрестер мен ғылыми-практикалық конференцияларда 50 баяндама жасады, ғылыми-зерттеу нәтижелері бойынша 17 енгізу жүзеге асырылып, 5 патент алынды.
Соңғы жылдары кафедрада бес магистрлік диссертация қорғалды: М. Жақсылықова, Э. Ильясова, А. Балқан, Е. Бөріхан, С. Көбеков. Сонымен қатар үш PhD докторлық диссертациясы қорғалды: Ю.А. Менчишева, М.А. Мұғалбаева, Ж.У. Еркібаева.
Хирургиялық стоматология кафедрасының ғылыми-техникалық жобалары:
- Жас ғалымдардың ғылыми және ғылыми-техникалық жобаларын гранттық қаржыландыру жобасы: «Оральді хирургияда инновациялық операциялық технологиялар мен плазма ұнтағын қолдану», іске асыру мерзімі – 2021–2023 жж. Жоба № AP09057870, 24.02.2021 ж. № 65-КМУ2 келісімшарт, мемлекеттік тіркеу № 0121РК00023.
- «Қазақстанның егде жастағы тұрғындарының белсенді ұзақ өмір сүруін қамтамасыз ету мақсатында қартаюға қарсы бағдарламаны әзірлеу». ҚР Денсаулық сақтау министрлігі, 2011–2013 жж.
- «Дентальді имплантация кезінде жасушалық технологияларды қолдану». ҚР Білім және ғылым министрлігі, 2011 ж.; ҚазҰМУ, 2013 ж.
- «Трансляциялық медицинаны қалыптастыру мен дамытуды ғылыми-әдістемелік негіздеу». Жоба жетекшілері: Г.О. Үстенова, Г.С. Стабаева. ҚР Білім және ғылым министрлігі, 2012–2014 жж.
- «Жалпыланған пародонтиттің жүректің ишемиялық ауруының даму қаупінің факторы ретіндегі әсерін бағалау». ҚазҰМУ, 2013 ж.
- «Күйік және хирургиялық жараларды емдеуге арналған табиғи полимерлер негізіндегі биожабындар». Жоба жетекшісі: М.З. Қауланбаева, «Антиген» ҒӨК ЖШС жасушалық технологиялар зертханасының меңгерушісі. Жауапты орындаушы: Г.С. Стабаева. ҚР Білім және ғылым министрлігі, 2014–2016 жж.
- «Терінің тіндік эквивалентін қолдануды әзірлеу және эксперименттік негіздеу». Жоба жетекшісі: Г.С. Стабаева. ҚазҰМУ, 2015 ж.
- «Қазақстан Республикасында пародонттың қабыну ауруларын диагностикалау, емдеу және болжаудың кешенді бағдарламасын әзірлеу». Жоба жетекшісі: Г.Т. Ермұханова, жоба фрагментінің жетекшісі: В.П. Русанов. ҚР Білім және ғылым министрлігі, 2015–2017 жж.
- «Әзірленген отандық тері тіндік эквивалентінің тиімділігі мен қауіпсіздігіне шектеулі клиникалық зерттеулер жүргізу». Жоба жетекшісі: Г.С. Стабаева. ҚазҰМУ, 2016 ж.
- «EXE, HTML форматтарында электрондық оқу-әдістемелік кешендерді құру жөніндегі нұсқаулықты әзірлеу және енгізу негізінде білім беру үдерісін оңтайландыру». Жоба жетекшісі: М.И. Вансванов. ҚазҰМУ, 2016 ж.
- «Оральді хирургияда инновациялық операциялық технологиялар мен плазма ұнтағын қолдану». № AP09057870, 24.02.2021 ж. № 65-КМУ2 келісімшарт. Жоба жетекшісі: Ю.А. Менчишева.
Қазіргі уақытта кафедрада Ғылым қорының «Сүйек ақауларын алмастыруға арналған біріктірілген ксеногендік материалдардың сериялық өндірісін ұйымдастыру» атты коммерцияландыру жобасы жүзеге асырылуда. Жобаны іске асыру мерзімі – 2025–2027 жж. Жоба жетекшісі – Ю.А. Менчишева.
Төменде 2027 жылы өндіріске шығаруға жоспарланған отандық ксеногендік материалдардың суреттері ұсынылған.



